① 一級小型船舶操縦士

ボート免許のトップクラスです。(ただし、水上オートバイは操縦できません。)
この免許を持っていれば、ヨットなどで世界一周も可能です。
受 験 資 格:17歳9か月以上 
免 許 発 行:満18歳~
航行できる水域:制限なし
操縦できる船舶:総トン数20トン未満のボート、ヨットまたは用途がスポーツやレクリエーションに限定された長さ24メートル未満のボート、ヨット

②二級小型船舶操縦士

沿岸のレジャーに最適です。(ただし、水上オートバイは操縦できません。)
沿岸や湖での釣り、あるいはウェイクボードのトーイングなど、陸から近い場所でボートを楽しむ方に適しています。
受 験 資 格:15歳9か月以上 
免 許 発 行:満16歳~
航行できる水域:平水区域及び陸岸から5海里(約9.26km)まで
操縦できる船舶:総トン数20トン未満のボート、ヨットまたは用途がスポーツやレクリエーションに限定された長さ24メートル未満のボート、ヨット

③特殊小型船舶操縦士(水上オートバイ)

水上オートバイに乗るならこの資格です。 特殊は、水上オートバイ専用免許で、ボートは操縦できません。
逆に一級・二級を持っていても、特殊を持っていなければ水上オートバイは操縦できません。
ボートと水上オートバイの関係は、自動車と自動二輪車に例えると理解しやすいでしょう。
受 験 資 格:15歳9か月以上 
免 許 発 行:満16歳~
航行できる水域:陸岸の発着点から沖へ2海里(約3.7km)、左右に15海里(約27.8km)まで
操縦できる船舶:水上オートバイ(ウォータージェット推進のボートを除く)